Časopis Mezi řádky vychází čtvrtletně v rozsahu 16 stran a je zasílán čtenářům zdarma. Jeho základní strukturu tvoří především teoretická a praktická část. Teoretická část odpovídá tak jako část praktická zhruba jedné polovině rozsahu časopisu a je koncipována jako prostor pro prezentaci filosofických a morálních východisek dotýkajících se mnoha aspektů každodenního života moderního člověka, jeho vztahu ke svým nejbližším i k ostatním příslušníkům společnosti. Tato východiska se opírají hlavně o principy křesťanské filosofie a morálky, ale díky své univerzalitě se dotýkají mnoha styčných bodů s ostatními náboženstvími. Jak již bylo uvedeno výše, časopis Mezi řádky není svým obsahem vázán výlučně na žádnou konfesi, nicméně články v něm publikované se snaží nabídnout čtenáři pevné a univerzální pravdy o životě člověka.

Obsahem praktické části časopisu jsou především texty mající za cíl přiblížit a objasnit praktickou stránku filosofických a morálních východisek, které jsou v časopise průběžně prezentovány. Hlavní snahou je otisknout takové texty, které každému člověku umožní orientovat se v často nepřehledném množství informací, které současná média prezentují. Proto jsou publikované články zaměřeny na rozvoj a upevnění rodinných svazků, rady pro nastávající i současné rodiče a rozvoj tolerance v postmoderní společnosti. Všechny tyto texty se opírají o bohatou moderní zkušenost společenských věd jako psychologie, sociologie a antropologie.